掌审核三司所属盐铁、度支、户部帐籍，检查出入之数。判司官一人，以朝官充任。

审计的一般程式是:季终或年终,中央及各地账籍分别不同种类,归口上报盐铁、度支、户部,其中有关山泽之货、关市、河渠、军器之事,报盐铁勾院;有关财赋入出之籍报度支勾院;有关户口、税赋、榷酒等籍报户部勾院。经三勾院审核勾考之后，再转呈都磨勘司複审。都磨勘司，宋初为三司磨勘司,端拱二年(公元989年)始设三司都磨勘司,至道间(公元995—997年),又设提点三司公事,不久废,其账籍拨归都磨勘司。元丰改制后,三司之事"悉总于户部",都磨勘司也划归户部,史称“户部磨勘司”南宋时,磨勘司与审计院并立,分别负责全国和诸军诸司的出纳账籍审计事宜。