根据规划，太湖三山岛湿地公园将在退渔还湖、退塘还湿的基础上，进行湿地保护与恢复，恢复三山岛原有的河流和湖滨带，与山色、太湖风光形成独特的岛屿风光。综合现状，太湖三山岛湿地公园将划分为5大功能区：生态保育区、管理服务区、宣教展示区、湿地体验区、社区共建区，重点进行保护规划、恢复规划、科普宣教规划、科研监测规划和合理利用规划等5个专项规划，通过保护和恢复区内湿地资源与环境，提升湿地公园生态价值，通过开展湿地生态旅游和科研宣教显现湿地公园的经济和社会价值。建设以吴文化、渔文化、佛教文化、地球科学文化、明清建筑文化、远古文明、船文化和石碑石雕文化为特色，集湖泊、岛屿风光为一体，融保护、恢复、利用、研究、游览、体验、宣传教育为一体的湿地公园。