空肠与迴肠均由肠系膜连于腹后壁，其活动度较大。空肠与迴肠的黏膜形成许多环状襞，襞上有大量小肠绒毛，因而极大地增加了小肠的吸收面积。环状襞在空肠上1/3段，最密最高，向下逐渐减少变小，到迴肠下部几乎消失。黏膜层内含有淋巴滤泡，分孤立淋巴滤泡与集合淋巴滤泡两类，前者分散于空肠与迴肠黏膜内，后者多见于迴肠下部，有20～30个，呈梭形，其长轴与小肠长轴一致，常位于迴肠的对系膜缘。肠伤寒的病变发生在集合淋巴滤泡，可并发肠穿孔或肠出血。

空肠与迴肠在腹腔内迂曲盘旋形成肠样。空、迴肠二者之间没有明显的分界，但外观上，空肠管径较租，管壁较厚，血管较多，颜色较红；而迴肠管径较细，管壁较薄，血管较少，颜色较浅。此外，肠系膜的厚度从上到下逐渐变厚，脂肪含量越来越多。空、迴肠肠系膜内血管的分布也有区别，空肠的直血管较迴肠长，迴肠的动脉弓的级数多（可达4级或5级弓），而空肠的动脉弓级数少。

距迴肠末端0.3-1m範围的迴肠壁上，约2%的成人有长2-5cm的突起，自肠壁向外突出，口径略细于迴肠，称Meckel憩室，此为胚胎时期卵黄蒂未消失形成的。此憩室可发炎或合併溃疡穿孔，因其位置靠近阑尾，故症状与阑尾炎相似。