2017年11月8日，太湖流域水科学研究院（以下简称太湖研究院）在上海正式成立，成为我国首个流域层面的水利科技领域高层次协作平台，也是流域水利科研机制的创新实践成果。

太湖研究院由水利部太湖流域管理局、南京水利科学研究院、河海大学、上海勘测设计研究院有限公司共同发起，将围绕太湖流域防洪、水资源、水生态环境、综合管理、水利信息化、工程技术等领域的科技问题，以及重大前瞻性、基础性科学问题，编制流域水利科技问题报告，开展科研攻关和技术谘询活动，解答流域热点难点问题，促进科研成果在流域综合治理与管理中的套用，培养从事流域水科学研究的高层次人才。