起自肾盂下端，经过腰大肌前下行至其中点附近，与睪丸血管（男性）或卵巢血管（女性）交叉，通常位于血管的后方走行，达到骨盆入口。在此处，左侧输尿管越过左髂总动脉末端前房；右侧输尿管则越过右髂外动脉起始的前方。

自小骨盆入口处，经过盆腔侧壁，髂内血管、腰骶乾、骶髂关节前方下行，跨过闭孔神经血管束，达坐骨棘水平。男性输尿管走向前、内、下方、胫直肠前外侧壁与膀胱后壁之间下行，在输精管后外方与之交叉，从膀胱底外上角向内下斜穿膀胱壁。两侧输尿管达膀胱壁处相距约5厘米。女性输尿管经过子宫颈外侧约2.5厘米处，从子宫动脉后下方绕过，行向下内至膀胱底穿入膀胱壁内。

位于膀胱壁内，长约1.5CM斜行的输尿管部分。在膀胱空虚时，膀胱三角区的两侧输尿管口间距约2.5CM。当膀胱充盈时，膀胱内压力升高能使壁内部分闭合，从而阻止尿液由膀胱向输尿管反流。