经审查，1992年至1997年间，陈志清利用在国库处从事地方预算核算工作之便，伙同同案犯包琪、朱向荣、程海林、苟远峰（已死亡）、袁海彬（在逃）等9人，採用退税、假拨款、涂改票据等手段，累计作案13起，侵吞国库资金达1549．3万元。

此案在1999年2月由西宁市人民检察院反贪局立案侦察，其间历经数次起诉和补充侦查。2001年1月西宁市中级人民法院一审当庭判处陈志清死刑，剥夺政治权利终身。陈不服，抗诉至青海省高级人民法院。

2001年4月，青海省高级人民法院以“原审判决部分事实不清”等为由，发回西宁市中级人民法院重审。同年6月，西宁市中级人民法院开庭重审后判处：陈志清死刑，同案犯包琪死刑、缓期两年执行，同案犯朱向荣、程海林无期徒刑，同案犯高正标、金哓华、房广亮、李宁有期徒刑6至2年不等。宣判后，陈志清等人均表示不服，提出抗诉。青海省高级人民法院于2001年11月公开开庭审理，驳回陈志清等人的抗诉，作出维持原判的判决。

2001年12月，青海省高级人民法院把判决依法报送最高人民法院核准，最高人民法院于2002年5月16日以（2002）刑复字第13号刑事裁定书，依法核准以贪污罪判决陈志清死刑，剥夺政治权利终身，并处没收个人全部财产的刑事判决。

据了解，这是建国以来我国最大一笔贪污国库资金案，也是青海省最大的一起贪污案，截至目前只追回230多万元赃款及部分赃物，其余赃款均被挥霍或至今无法追回。

2002年5月30日上午被执行枪决。