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兼併引物PCR

兼併引物PCR

兼併引物PCR (degenerate primer PCR) 是指用设计引物的方法来扩增所有已知顺序核苷酸序列的PCR 法。因为密码子具有兼併性,为了扩增一些已知编码顺序的核酸序列,可通过设计兼併引物进行扩增。兼併引物是指代表编码单个胺基酸所有不同硷基可能性的不同序列的混合物。兼併度越低,产物特异性越强。

因此,在引物设计时,最选择兼併性小的胺基酸,并避免引物3'端被兼併,因为3'端最后3个硷基的退火足以在错误位点起始PCR;次黄嘌呤可以同所有的硷基配对,降低引物的退火温度。实验证明,用脱氧肌苷引物进行PCR,可以代替编码蛋白的多种兼併密码子中的兼併硷基。

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