根据上述主要任务，市住房公积金管理中心内设4个科。

负责综合协调日常工作；负责文秘、档案、机要、人事、保密、信访、接待、信息、计画生育、会议组织、后勤服务和安全保卫工作；负责收集、汇总信息，做好电算化管理工作。

负责宣传贯彻住房公积金政策，执行住房公积金归集计画；负责住房公积金缴存年审年检、缴存基数调整工作；受理单位住房公积金降低缴存比例或缓缴申请手续的报批；负责组织和实施行政执法工作，经办行政执法案件的核实、听证、应诉等工作。

编制、执行年度住房公积金个人住房委託贷款规模和计画；负责申请受理贷款资格审核、签约、发放、回收、催收等工作；负责组织业务经办网点开展相关业务；负责对逾期贷款的提起诉讼和抵押物处理、清欠工作。

负责编制住房公积金预算、决算报告；负责住房公积金的核算和稽核；负责办理住房公积金帐户的开设和职工住房公积金支取、转移、封存、销户业务。

驻马店市住房公积金管理中心事业编制名，其中主任1名，副主任名，科级领导职数名。经费实行全额预算管理，收支两条线。

市住房公积金管理中心分别在遂平、西平、上蔡、汝南、平舆、新蔡、正阳、确山、泌阳和驿城区等10个县区各设一个业务经办网点，科级规格，主要负责辖区内住房公积金业务管理工作。每个业务经办网点事业编制名，其中负责人1名。经费实行全额预算管理，收支两条线。