严重缺氧和混合型酸中毒使肺动脉痉挛或其肌层增生（长期低氧血症），使肺动脉阻力增高，右心压力增加，导致卵圆孔水平的右向左分流；同时有可使处于功能性关闭或未闭的动脉导管重新活保持开放，导致导管水平的右向左分流。使低氧血症和混合型酸中毒进一步加重，形成恶性循环，即新生儿持续肺动脉高压。