全民健保将在台湾地区设有户籍者，除特殊情形（如服刑中、失蹤达半年以上及因长期出国而申请停保者），均纳入强制加保对象，且依身份分为六大类：

第一类：有僱主之公民营机构员工。

第二类：无僱主但有加入同业工会之人。

第三类：农渔业从业人员。

第四类：服兵役及替代役人员。

第五类：合于法规规定之低收入户。

第六类：荣民及其眷属和不属第一至第五类之人。

各类均有各自的投保单位，纳保对象向投保单位申请加保后，每个月要缴交一定的保费，有的投保单位全额或部分负担纳保对象的保费。保费会上缴到健保局，而健保局会透过投保单位发给纳保对象一张卡片，此卡片称为「全民健康保险卡」（2004年1月起改为IC晶片卡（智慧卡），之前则是纸卡）当纳保者到有参与全民健保的医疗院所就医时，可以只缴纳部分的医疗费以及药物费，医疗院所则凭纳保者的就医资料向健保局申请费用。

但并非每一种病症均可获得健保的给付，如整形手术，而也非每一种药物及医疗器材均可获得健保给付。是否给付及给付的额度由健保局订定。

健保实施后，可让民众获得医疗保障，而健保所提供的成人健康检查服务，提供了免费的基本检查，增进了民众的健康。

健保实施后，由于有的民众滥用健保，加以部分医疗院所不正当浮报费用，造成健保基金有亏损的情形。健保局正研拟「二代健保」以改革目前健保的缺失。