检查线索细胞需要做涂片染色，但不包含在常规检查之中。主要是结合其他的检查项目来确定是否有阴道炎及指导用药。细菌性阴道病诊断的金标準是革兰染色发现线索细胞。在镜检时发现大量短小桿菌及上皮细胞，酸硷度，胺试验为常用的检测方法。一般的描述是：线索细胞来自于大型扁平上皮细胞，其表面附着有大量的短桿菌，表面看起来显得粗糙、有斑点和颗粒，细胞边缘不整齐。这种细胞的出现多与细菌性阴道炎有关，故发现大量的线索细胞时，可初步怀疑患者有细菌性阴道病。

线索细胞是细菌性阴道病的最敏感、最特异的体徵，可根据胺试验阳性及有线索细胞即可做出细菌性阴道病的诊断。

检查线索细胞前三天禁止性交，并在前一天的晚八时以后应禁食。且检查应在月经乾净后的3～7天。在检查时可能会对身体及心理造成负担，应放鬆心情。