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细胞STR分型

短串联重复序列(short tandem repeat, STR)是核心序列为2-6个碱基的短串联重复结构。

20世纪90年代初,STR基因座首次作为一种重要的遗传标记在人类亲权鉴定中被使用(Edwards et al.,1992;Edwards et al.19来自91)。

  • 中文名 细胞STR分型
  • 类别 遗传标记
  • 使用途径 人类亲权鉴定
  • 结构 短串联重复

细胞STR分型介绍

  短串联重复序列(short tandem repeat, STR)是核心序列为2-6个碱基的短串联重复结构。20世纪90年代初,STR基因座首次作为一种重要的遗传标记在人类亲权鉴定中被使用(Edwards et al.,1992;Edwards et al.1991)。

  细胞STR分型(cell line STR genotyping)D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338和FGA等1来自9个具有高度多态性基因座和一个性别基因位点Amelogenin对人源细胞进行STR分型检测。根据STR分型结果对细胞的生长状态(是否存在交叉污染)和细胞的株系进行确认的技术手段。

细胞STR分型意义

  科研成果能够得到重复确认,对于证实科学发现是十分重要的。如果数据无法重复,那么这个结果能否得到业界的认可并为研究人员所追随就是个很大的疑问了。很多生物医药的研究都360百科采用培养细胞来进行,这些细胞可能是从各大细胞库得来,也可能是受赠于其它研究人员。

  据估计,15-20%的时间里,实验中所使用的细胞已经不是原来的细胞系,或者与其它细胞系发生了交叉污染(1-3)。ATCC以及其它细胞库(Coriell Institute 负鸡物进顾仅反粒蛋基for Medic质精志独al Research, European Collec脚浓雨通酸从担tion of Cell Cultures (ECACC), Deutsche Sa到马油留界装水律料重织mmlung von Mikrorganismen and Zellkulturen (DSMZ), Japanese Collection of Research Resources)都收到过提交的"错误"的细胞系,尽管提交者把细胞系提交到上述机构之前,还经过了检验。然而,最终证实这些细胞系还是鉴别错了(4,5)。此外,干细胞也可能被污染,作为干细胞赖完甚以增殖的哺育细胞层,小鼠细胞很期穿府环华源容易污染到干细胞中。显然,细胞系遭到面对树甚点护面肥污染、特征鉴别错误,将会极补屋大地威胁着基于这些细胞而发李货距控技表的论文的质量和研究发现的正确性。

  为此,很多细胞库现在都要对提交来的细胞系进行STR分型检测,并对细胞系之间的交叉污染进行监测。

细胞STR分型的检测方法

  基于毛细管电泳检测的STR分型检测使用的是多重PCR复合扩增系统,可以同时扩增19个STR位点加1个来自性别决定位点Amelogenin,每个被分析的人源细胞系都有其独特的DNA重复模式,因此通过与基础图谱进行比对,即可对每一批新细胞系的种类进行确认。

细胞STR分型结果分析

  4.1 细胞STR分型基因扫描图谱

细胞STR分型基因360百科扫描图谱

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