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NWChem

NWChem是运行在高性能并行超级计算和通常工作站集群上的计算化学软件,可以用在大多数计来自算平台上。N践分务用爱先境WChem使用标准量子力学描述电子波函或密度,计算分子和周期性系统的特性,还可以进行经典分子动力学和自由能模拟。

  • 外文名称 NWChem
  • 类别 计算化学软件
  • 运行平台 高性能并行超级计算机
  • 功能 经典分子动力学和自由能模拟

分子的电子结构

  1) 下面的方法排友计算原子坐标的能量,建承解析一阶导和二阶导。

  自来自恰场(SCF)或Hartree-Fock(RHF,UHF)

  高360百科斯密度泛函理论(DFT),使用正常的N3和N4标度的局域,非局域(梯度校正)和杂化(局域,非局域和HF)的自旋限制交换-关联势

  2) 下面的方法计算原子坐标通蛋妒细管路朝乎的能量和解析一阶导。二阶凯灯减二课展各导由一阶导的有限差分计算。

 款古革减显效映聚 自恰场(SCF)或H美聚家乙卷兰草流色异答artree-Fock(草简究试RHF,UHF,高自旋ROHF)

  高斯密度点得鸡业泛函理论(DFT),使用正常的N3和N4标度的局域和非局域交换相关势(RHF或UHF)

  自旋-轨道DFT(SODFT),使用多种局域和非局域交换相关势(UHF)

  MP2,包括使用冻芯以及RHF和UHF参考的半直接MP2

  客众步者料器单固出同兰完全活性空间SCF(CASSCF)

  束缚DFT

  加入经验性长程色散校正的DFT-D方法

  3) 下面的方法仅用于计算能量。一阶导和二阶导由能量的有限差分计算。

  CCSD,CCSD(T),CCSD+T(CCSD),使用RHF参考

  二级微扰修正的选择CI。选择参考组态的CI+微扰修正可以进行激发态的能量计算,并可以对激发态进行几何优化。

  使用RHF参考的完全直接MP2

  分解恒等积分近责然间音的似MP2(RI-MP2),使用RHF和UHF参考

  处院使用RHF,UHF,RDFT,或UDFT参考的CIS,TDHF,TDDFT,和Tamm-Dancoff TDDFT用于激发态计算

  用于闭壳层和开壳层体系的CCSD(T)和CCSD[T](TCE模块)

  使用RHF,UHF,或ROHF参考的UCCD,ULCCD,UCCSD,ULCCSD,UQCISD,UCCSDT,和UCCSDTQ

  使用RHF,U再欢整北HF,或ROHF参考的UCISD,UC盟里开五额理盾济足保ISDT,和UCISDTQ

  使用RHF或UHF参考的非正则UMP2,UMP3,和UMP4

  EOM-CCSD,EOM-CCSDT,EOM-CCSDTQ用于闭壳层和开壳层体系激发能、班农临房张宽但跃迁矩和激发态偶极矩的计算

  CCSD,CCSDT,CCSDTQ用于闭壳层和开壳层体系偶极矩的计算

  在TCE模块中,用二次近似的单双耦合簇模型(CC2)计算激发能

  4) 下面的方法可用于计算分子特性。

  使用限制或非限制参考的耦合簇线性响应

  用线性响应方法计算CCSD和CCSDT级别的基态动态极化率

  用线性响屋装干讲兰话急围应方法计算CCS雨侵尔特套乱DTQ级别的动态偶极极化率

  5) 对所有的方法,下面的操作都适用。

  单点能

  几何优化(最小值和过渡态)

  整个从头势能曲面上的分子动力学

  如果不能用解析导数,自动计算数值的一阶和二阶导

  笛卡尔坐标的简正振动分析

  Morokuma及其合作者的ONIOM混合方法

  产生电子密度文件用于图形显示

  求解静态和单电子特性

  原子局部电荷的静电势匹配(CHELPG方法,可以加上RESP限制或电荷约束)

  6) 对于闭壳层和开壳层的SCF和DFT:

  COSMO能量

  7) 另外,自动提供到以下程序的接口:

  NBO包。

  Python

  8) 密度泛函:

  数十种LDA和GGA泛函(VWN,Becke97,Becke98,HCTH系列,OPTX,MPW91等),以及meta-GGA泛函。

相对论影响

  以下的方法可以在量化计算中包含相对论:

  无自旋单电子Douglas-Kroll近似用于所有量子力学方法及其梯度。

  Dyall的无自旋改进Dirac哈密顿量近似用,于Hartree-Fock方法及其梯度。

  通过自旋-轨道势包含单电子自旋-轨道影响。这个选项用于DFT及其梯度,但不能用对称性。

  对于DFT,可以用无自旋的和自旋-轨道的ZORA

赝势福好平面波电子结构

 胶杆连什然照福右 1) 下面的模块使用赝势平面波来自DFT,计算能量,结构优化,数值二阶导,以及从头分子动力学。

  PSPW(赝势句远副平面波),Gamma点程序,用于计算分子、液体、晶体、表面。

  Band,标准的能带结构代码,用于计算具有小带隙(如半导体和金属)的晶体和表面。

  GAPSS,周期过普节乱安侵期体系电子结构LCAO模块(聚合物,表面和固体的高斯方法),使用包含多种局域和非局域交换相关势的高斯DFT,用于计算能量(4.6以上新版本不包含这个模块)

  2) 计算使用:

  共轭梯度和有限仅盐犯内存的BFGS最小化

  Car-Parrinello(扩展拉格朗日动力学)

  常温恒定能量下Car-Parrinello模拟

  在Car-Parrinello中固定原子的笛卡尔坐标和SHAKE束缚

  赝势库

  Hamann和Troul天马你审际晶味西宁委冷lier-Martins模守恒赝势,可以用半芯校正

  自动的波函初始猜测,现在使用LCAO

  Vosko和PBE96交换关联势(自旋限制与非限制)

  非周期正交模拟单元,用于计算带电或高度极化的分子

  用周期和自由空间边界条件,正交模拟晶胞

  大、小平面波展开之间的转换模块

  到DRIVER,STEPPER和VIB模块的接口

  通过使用点电荷计算极化率

  Mulliken分析,点电荷分析,D360百科PLOT分析(波函,密度,和静电势绘图)

  BAND加入费米模糊技术

  BAND加入二分量相对论波函

  BAND加入HGH自旋-轨道势

  BAND加入Hilbert分解并行FFT

  PSPW加例素仅投候军细不入Car-Parrinello QM/MM

  非立方晶胞现在可以产生Wannier轨道

  PSPW使用新的并行分解,用于FFT格点和轨道

  PSPW加入分数占据的分子轨道

  二维处理器格点用于PSPW

  PSPW加入Born-O亮杀ppenheimer动力学选项

分子动力学

  1) 以下功能用于经典分子模拟:

  单构型能量求解

  能量最小化

  分子分酒烈放动力学模拟

  自由能模拟

  2) 经典和量子描述的组合,执行:

  QM/MM能量最小化和分子动力学模拟

  使用任何能计算梯度的量子力学方法进行量子动力学模拟

  3) 通过用DIRDYVTST模块,用户可以为POLYRATE程序写输入文件,计算化学反应速率常数,包括量子画此力学振动能和隧穿的贡献。

DNTMC

  新的动力学核理论Monte Carlo模块,用于确定分子团簇的几率分布和蒸发率。

Python

  NWChem内植了Python程序语言,用户可以很容布套毛镇传易地组合和控制NWChem的许多高级功能,进行复杂的操作

并行工具和库

  ParSoft

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